Towarzystwo jest de facto organizacją non-profit od 1962 roku. Przez pierwsze trzy lata po powstaniu (1925-1928) otrzymywało dotacje od instytucji i osób fizycznych na uruchomienie działalności i funkcjonowanie.

W 1949 roku subwencja od Prezydium Rady Ministrów.

W latach 1959-1960 dotacja od Polskiej Akademii Nauk pokrywała w około 20% kosztów TNOiK,

W latach 1961-1964 Polska Akademia Nauk udzielała wytycznych co do stawek wynagrodzeń pracowników zatrudnionych w TNOiK.